Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms