Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms