Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms