Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms