Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLFNL1Q499Z3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms