Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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