Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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