Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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