Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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