Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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