Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms