Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRKQ15262 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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PTPRKQ15262 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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PTPRKQ15262 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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PTPRKQ15262 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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PTPRKQ15262 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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PTPRKQ15262 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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PTPRKQ15262 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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