Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAPVD1Q14C86 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms