Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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