Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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