Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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