Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 HERC2P4-202ENST00000564145 683 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AL353770.4-202ENST00000621296 1126 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 BX005040.1-201ENST00000622281 1126 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms