Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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FOXE3Q13461 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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FOXE3Q13461 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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