Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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