Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPA4Q13156 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPA4Q13156 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPA4Q13156 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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RPA4Q13156 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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RPA4Q13156 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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RPA4Q13156 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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RPA4Q13156 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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