Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHAF1AQ13111 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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