Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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NFIAQ12857 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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NFIAQ12857 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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NFIAQ12857 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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NFIAQ12857 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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NFIAQ12857 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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