Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TROQ12816 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TROQ12816 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
TROQ12816 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TROQ12816 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TROQ12816 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
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