Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms