Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms