Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms