Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms