Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms