Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms