Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms