Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CASQ1P31415 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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