Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms