Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRHP20396 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRHP20396 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRHP20396 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRHP20396 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRHP20396 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRHP20396 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRHP20396 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRHP20396 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRHP20396 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRHP20396 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRHP20396 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRHP20396 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRHP20396 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRHP20396 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRHP20396 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRHP20396 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRHP20396 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRHP20396 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRHP20396 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRHP20396 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms