Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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