Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMC1P11047 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMC1P11047 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMC1P11047 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMC1P11047 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms