Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1AO95602 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms