Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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