Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAN1Q9Y2M0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms