Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASF1AQ9Y294 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASF1AQ9Y294 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms