Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RAB23Q9ULC3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RAB23Q9ULC3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RAB23Q9ULC3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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