Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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