Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms