Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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