Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms