Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms