Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms