Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL1Q9NSC2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms