Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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