Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms