Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms